机井射频卡灌溉控制系统主要实现对机井水泵的启停、计费控制，由射频卡控制器、电动保护装置、遥控器、充值管理机等组成，其中射频卡控制器实现对机井水泵的控制，并实现计费功能。电动机保护装置实现对电动机的保护，如缺相、过载等，遥控器可以实现1KM范围内对水泵的遥控操作，充值管理机用于对射频卡进行充值管理。
将嵌入IC卡智能控制器（节水灌溉智能控制器）的机井控制箱与现场设备对接任意一部安装了经济管理APP的安卓手机，通过连接蓝牙读卡器，对于IC卡进行开卡、充值的管理，用水户可通过简单的刷卡流程，操作灌溉机井取水，停水取水时根据水量、电量扣除相关费用。机井控制器与手机均可以通过GPRS、3G、或4G网络与中心服务器同步通讯。村级中心与上级管理中心能远程访问服务器，取得并管理相关数据。
农户在浇地前必须先持IC卡，然后刷卡浇地，浇地完成后再次刷卡关闭水泵，取走卡内余额，在本次浇地过程中用了多少水（电）费，就自动从农户卡内扣除多少，卡内余额用完，自动停泵，一台井电双控智能控制器可以供多个农户（轮流）使用。一台井电双控智能控制器可供10000个农户使用。